Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efr3aQ8BG67 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efr3aQ8BG67 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms