Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katnb1Q8BG40 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnb1Q8BG40 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms