Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sv2bQ8BG39 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms