Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smim19Q80ZU4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smim19Q80ZU4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms