Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc28Q80XJ3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ttc28Q80XJ3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ttc28Q80XJ3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ttc28Q80XJ3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ttc28Q80XJ3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ttc28Q80XJ3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc28Q80XJ3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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