Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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Pcsk9Q80W65 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms