Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup214Q80U93 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms