Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms