Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg1cQ7TSF0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms