Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2lQ7TS74 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms