Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SyncripQ7TMK9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SyncripQ7TMK9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms