Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ScocQ78YZ6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScocQ78YZ6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms