Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms