Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms