Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms