Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms