Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc46a1Q6PEM8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms