Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms