Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc36Q6PDM4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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