Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms