Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC061212Q6P8K3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms