Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Efcab6Q6P1E8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms