Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Soga3Q6NZL0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms