Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rprd2Q6NXI6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rprd2Q6NXI6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms