Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HelbQ6NVF4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HelbQ6NVF4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms