Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cep78Q6IRU7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms