Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tpm4Q6IRU2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tpm4Q6IRU2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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