Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Arhgap20Q6IFT4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms