Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk13Q69ZA1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk13Q69ZA1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk13Q69ZA1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms