Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Arhgef39Q66JY6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgef39Q66JY6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Arhgef39Q66JY6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Arhgef39Q66JY6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgef39Q66JY6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgef39Q66JY6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgef39Q66JY6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Arhgef39Q66JY6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Arhgef39Q66JY6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgef39Q66JY6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Arhgef39Q66JY6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms