Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc8eQ66JT1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms