Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clcn1Q64347 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Clcn1Q64347 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clcn1Q64347 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms