Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbr1Q64336 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbr1Q64336 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms