Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zfp248Q640N4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Zfp248Q640N4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Zfp248Q640N4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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