Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vat1Q62465 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms