Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nptx1Q62443 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms