Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spock1Q62288 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms