Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ttf1Q62187 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ttf1Q62187 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ttf1Q62187 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ttf1Q62187 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttf1Q62187 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttf1Q62187 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttf1Q62187 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ttf1Q62187 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttf1Q62187 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ttf1Q62187 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ttf1Q62187 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttf1Q62187 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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