Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sema3cQ62181 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms