Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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