Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd1Q62101 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prkd1Q62101 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms