Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms