Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PcolceQ61398 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PcolceQ61398 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PcolceQ61398 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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