Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcanQ61361 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BcanQ61361 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BcanQ61361 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms