Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usf1Q61069 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usf1Q61069 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usf1Q61069 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usf1Q61069 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usf1Q61069 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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