Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms