Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms