Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms