Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stxbp3Q60770 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms