Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema5bQ60519 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms